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As tartarugas mutantes Leonardo, Raphael, Michaelangelo e Donatello já se tornaram mestres na arte do ninjutsu e há muito tempo combatem a criminalidade. Eles descobrem que existe outra tartaruga mutante, a fêmea Venus De Milo, que se une aos ninjas para enfrentar um novo inimigo Dragonlord, depois que o temido Destruidor morre.